Nazywają siebie Borg. Są symbiotycznym połączeniem komponentów organicznych i cybernetycznych. Nie ma wśród nich indywidualności - tworzą Kolektyw. Ich cel jest jasno określony - dążenie do perfekcji przez asymilowanie zaawansowanych technologicznie ras. Lęka się ich cała galaktyka...
Ludzie zawsze byli dla Borg jednym z największych wrogów, od momentu gdy Q zainicjował między nimi pierwszy kontakt, przenosząc Enterprise w daleki rejon galaktyki, gdzie stoczył on pierwszą w historii walkę z jednostką Kolektywu. Został uratowany tylko dzięki ponownej interwencji Q... 14 miesięcy po tych wydarzeniach Borg dociera w pobliże Układu Słonecznego. Przygotowuje się do inwazji na Ziemię. Porywa i asymiluje kapitana Picarda, aby jego ustami powiadomić Ziemian o czekającym ich losie. Ostatecznie oddziały Floty pokonują jednostkę Borg w jednej z największych bitew w historii kwadrantu Alfa. Straty są gigantyczne, w bitwie z jedną jednostką Borg stracono 11 tysięcy ludzi i 39 statków...
Akcja filmu toczy się ponad 6 lat po tej bitwie. Picard nigdy nie otrząsnął się w pełni ze swych przeżyć w czasie asymilacji. Jest już kapitanem nowego Enterprise. Tymczasem Borg powraca. Pod wodzą sadystycznej Królowej, Borg przeprowadzają diaboliczny plan zmiany historii - zasymilowania Ziemi w przeszłości, gdy obrona będzie praktycznie niemożliwa. Picard wraz ze swoją załogą muszą podjąć nierówną walkę z Borg w przeszłości - dokładnie w 2063 roku, na dzień przed Pierwszym Kontaktem Ziemian z obcą cywilizacją...

Borg, rasa odkryta przez załogę Enterprise przy pomocy Q, już kilka krotnie atakowała Federację. Przynosiął znisczenia, lecz zawsze groźba asymilacji zostawała oddalona. Borgowie uderzając kolejny raz decydują się zniszczyć źródło Federacji. Nowy USS Enterprise NCC-1701E, pod dowódcztwem kapitana Piccarda, próbuje zatrzymać Borgów. Ale tym razem celem jest Ziemia, lecz wiele lat wcześniej. Tylko cudem Enterprise także cofa się w czasie (XXI), kiedy to ludzie dopiero wymyślają naped warpowy. W tych czasach są bezbroni względm Borga. Z drugiej strony walka z nimi tutaj może spodować zmianę lini czasu. Nie będzie to łatwe zadanie ale Piccard i załoga też nie są zółtodziobami.

Dawno temu Borgowie porwali kapitana Jeana-Luca Picarda i uczynili z niego istotę pozbawioną woli. Gdy tylko Picard sie uwolnił, odzyskał jednocześnie siły i władzę. Jednak gdy na nowo rozgorzała walka z Borgami, zabroniono mu w niej udziału. Ale on, kapitan złamał ten zakaz, ruszając w pogoń za wrogami na pokładzie statku kosmicznego Enterprise-E, wprost do tunelu czasu. Borgowie zdeterminowani żądzą zawładnięcia Ziemią zdecydowali się na podróż w czasie. Postanowili dostać się do Błękitnej Planety w epoce, w której nie potrafiła jeszcze oprzeć się najeźdźcom.

Krążownik Enterprise powrócił na gwiezdne szlaki, strzegąc spokoju Zjednoczonej Federacji Planet. Kapitan Picard (Patrick Stewart) powstrzymuje Borgów aneroidalne istoty z odległych cywilizacji przed inwazją na Ziemię. Wtedy obdarzeni wspólnym mózgiem przeciwnicy cofają się w czasie, by uderzyć jeszcze raz: w wieku XXI - w okresie, kiedy wyniszczona wojną planeta nie mogła się bronić. Był to jednocześnie najważniejszy moment w dziejach wszechświata. To wówczas doszło do pierwszego oficjalnego kontaktu Ziemian z innymi istotami, co w rezultacie doprowadziło do powstania Federacji. Borgowie zamierzają udaremnić ten kontakt i nie cofną się przed niczym, by swój cel osiągnąć. Idąc ich śladem Picard cofa Enterprise o trzy stulecia, ale Borgowie wdarli się już na pokład krążownika...